因为艾灸后体内正邪交战，不能完全排除因为温度过高、皮肤过长时间高温导致出现水泡的症状。不同的人灸会出现不同反应，有的人开始皮肤会长痘痘，而有些人会皮肤发痒，还有的人艾灸后会出现水泡等反应。不同症状的水泡代表不同的体质。
艾草的作用还可以制成艾灸条，是艾灸条的主要原材料，用艾灸条艾灸是中国古老的一种治疗一些特定疾病的方法。具有通经活络，祛除阴寒，消肿散结，回阳救逆等作用。灸用艾叶，一般以越陈越好。中医认为，人是统一的整体，穴位是经络上的点，刺激穴位就能引起经络的反应，而经络是气血的通络，同时也是病邪的通路。艾灸治病主要是因为其通经活络的作用。