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三证合一，只是证件合一，是在政府职能部门的备案号合一，与以后记帐报税没有任何关系。原来怎么记账报税，就还是怎么记账报税。新公司办理好三证合一的营业执照后，还需要到国税和地税去进行登记。
一般情况下，专管员会主动通知纳税单位。
也可以主动联系专管员。进行纳税认证。
