1、物理方法 :换水，用软管按照虹吸原理将水中赃物带水一起吸出，然后补进水质相同或尽量相近的水，一般换去旧水的三分之一或一半，非必要情况不要使用全换水。也可以在鱼缸里装上电动过滤设备 ，接上电源，可以自动工作过滤去水中大颗粒杂物，需及时清洗过滤材料 。
2、生物方法:在鱼缸里铺上底砂如大理石 ，黑晶沙，河沙或仙土等，然后种植一定量的水生植物，在鱼类放养密度不是很大的情况下，底砂和水草可以沉淀吸附鱼类排泄物，水环境中的有益菌可以分解鱼类排泄物，水草可再次吸收利用有益菌的分解产物。如果鱼缸放养密度较大可以结合物理过滤的方法 。