使用马克笔时，可以通过调整马克笔的笔头和角度的倾斜度，来控制线条的粗细达到笔触效果。
马克笔绘画要求用笔速度极快且用力，要是达不到这样的要求，就可能会使画质出现断层，画面破碎。马克笔在用纸上时需要注意，虽然可以用于所有纸张，但不相同的纸张会产生不同的效果。应该选择纸张较为结实、表面光滑的纸张、吸水性较差，选用专用的纸张上绘画，如马克本。马克笔不适合大面积晕染，需要概括性的表达通过笔触的排列叠加几层即可。马克笔在上色有一个基本规律，受光面上浅下深，背光面恰恰相反。
如果清理瓷砖马克笔渍，可以用牙刷去适量牙膏，刷洗马克笔渍，软布擦干即可。要是清理木桌马克笔渍，可以用化妆棉蘸取酒精，擦拭桌面即可。要是清理地毯马克笔渍，可以倒适量酒精，化妆棉擦拭至污渍变浅，在污渍处喷适量发胶，化妆棉擦拭至污渍变浅即可。清理衣物马克笔渍：污渍处挤适量洗手液，化妆棉蘸开，倒适量小苏打，挤一些柠檬汁，用牙刷刷洗，正常清洗衣物即可。