1、去除水中的水霉菌方法，使用适量浓度的盐撒入水中，这样也可以起到去除水霉菌的作用。水霉病自然终止的条件：水温持续28度以上，这一条件下孢子无法萌发，持续三天五天基本就终止了。
2、新买回来的鱼儿发生水霉病，基本上都是因为捞鱼等操作造成体表外伤进而引起水霉继发的。处理方法：不买体表受伤的鱼；鱼儿买回来后先用痢特灵40-50ppm泡1-2小时再放入缸中；如果体表伤口明显的话，可以涂点软膏（土霉素软膏，四环素软膏，金霉素软膏，也可涂0.5%的孔崔绿或亚甲基蓝等等，主要目的是促进伤口愈和）；捞鱼时尽量用软的网具，动作要轻快。