大便发黑的原因有很多，一般情况下有以下三种原因：
第一是消化道出血，大便呈黑色或棕黑色，为上消化道出血最常见的症状之一。如果出血量较少，且出血速度较慢，血液在肠内停留时间较长，排出的粪便即为黑色，若出血量较多，在肠内停留时间较短，则排出的血液呈暗红色，出血量特别大，而且很快排出时也可呈鲜红色。常见的引发黑便的疾病有消化性溃疡病、急性胃黏膜病变、胃黏膜脱垂、胃癌等都会导致大便发黑。
第二是某些药物也可以引起大便发黑，比如补血的铁剂、口服活性炭末、治疗胃病的铋剂和某些中药等。
第三是食用含铁的食物也会使大便发黑，如进食猪血、鸭血或大量的牛肉、猪肝后，动物血中的铁可以在人体肠道内形成黑色的硫化铁，使大便的颜色变黑。