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湖内的鱼类从种类组成以鲤科为主，约占全湖种类的50%以上。若以生态类型区分三类：A湖泊定居型鱼类如鲤、鲫、鳊、鲂、鲌、刀鲚、银鱼、乌鳢、鳜、黄颡鱼等,它们终生定居于洪泽湖，其种群多、数量大，成为渔业产量中的主要鱼类，B索饵洄游型鱼类，如草鱼、青鱼、鲢、鳙、鳡鱼等。
