可以选择使用灭藻剂。
作非氧化性灭藻剂，一般投加剂量为50-100mg/L；作粘泥剥离剂，使用量为200-300mg/L，需要时可投加适量有机硅类消泡剂。灭藻剂可与其它杀菌剂，例如异噻唑啉酮、戊二醛、二硫氰基甲烷等配合使用，可起到增效作用，但不能与氯酚类药剂共同使用。投加1227后循环水中因剥离而出现污物，应及时滤除或捞出，以免泡沫消失后沉积。
灭藻剂在不同的PH值范围内均有很好的杀菌灭藻能力，能有效地挖去藻类繁殖和粘泥增长，并有分散和渗透作用，能渗透并去除粘泥和剥离附着的藻类，此外，还有去油能力。灭藻剂的主要成分：十二烷基二甲基苄基氯化铵。
灭藻剂与菌藻接触后，快速断开细菌和藻类蛋白质的键不可逆地抑制其生长、新陈代谢。从而导致微生物菌藻的死亡，故对常见细菌、真菌、藻类等具有很强的抑制和杀灭作用。杀生效率高，降解性好，具有不产生残留、操作安全、配伍性好、稳定性强、使用成本低等特点。杀灭藻类的同时并对对附着在管道壁上的生物粘泥有优异好的剥离效果。