1、定义不同
结构式：结构式是表示用元素符号和短线表示化合物（或单质）分子中原子的排列和结合方式的化学组成式。是一种简单描述分子结构的方法。
结构简式：结构简式，化学名词，是把结构式中的单键省略之后的一种简略表达形式，通常只适用于以分子形式存在的纯净物。
2、组合方式不同
结构式在表示分子式时采用了分子数量和化学键配合，而结构简式可以省略部分化学键直接用化学符号和阿拉伯数字表示分子式的组成。
3、表示方法不同
结构式是表示用元素符号和短线表示化合物（或单质）分子中原子的排列和结合方式的式子。是一种简单描述分子结构的方法。
结构简式就是结构式的简单表达式（通常只适用于以分子形式存在的纯净物，如有机分子），应表现该物质中的官能团：只要把碳氢单键省略掉即可，碳碳单键、碳氯单键、碳和羟基的单键等大多数单键可以省略也可不省略。