1、在调节作用上，别构调节多半以影响关键酶（代谢转折点的酶）使代谢发生方向性的变化为其主要作用；化学修饰调节则以放大效应调节代谢强度为主要作用。但也应看到它们的作用是相辅相成的，不可截然划分。有时这两种调节方式可以共存。有些酶具有别构与化学修饰双重调节。
2、别构效应又称为变构效应，是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象，导致蛋白质生物活性改变的现象。 别构效应（allosteric effect）是某种不直接涉及蛋白质活性的物质，结合于蛋白质活性部位以外的其他部位（别构部位），引起蛋白质分子的构象变化，而导致蛋白质活性改变的现象。